Разделите данные
Общий поисковый трафик скрывает разнонаправленные изменения. Рассматривайте Яндекс и Google отдельно, а затем сравнивайте результаты по одинаковым разделам, устройствам и периодам. Это способ точнее сформулировать проблему, а не обещание найти универсальное объяснение.
Сравнивайте страницы, а не только итоги
Если просел один раздел, общая цифра по сайту не подскажет, с чего начать. Выделите страницы с наибольшим изменением и проверьте, что с ними происходило: переработка текста, смена адресов, изменение доступности или спроса.
Используйте данные каждой системы
Сопоставляйте веб-аналитику с доступными отчётами Яндекс Вебмастера и Google Search Console. У разных отчётов разные определения метрик и способы подсчёта, поэтому полного совпадения цифр ожидать не стоит.
Ведите единый журнал
Записывайте даты публикаций и технических изменений рядом с наблюдениями по каждому источнику. Это помогает искать связи и ставить следующие проверки. Совпадение по времени остаётся отправной точкой для исследования, а не доказательством причины.